Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FlgP11088 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FlgP11088 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FlgP11088 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FlgP11088 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FlgP11088 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FlgP11088 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FlgP11088 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FlgP11088 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FlgP11088 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FlgP11088 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FlgP11088 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FlgP11088 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FlgP11088 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FlgP11088 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FlgP11088 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FlgP11088 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FlgP11088 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FlgP11088 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FlgP11088 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FlgP11088 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FlgP11088 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FlgP11088 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FlgP11088 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FlgP11088 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FlgP11088 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FlgP11088 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FlgP11088 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FlgP11088 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FlgP11088 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FlgP11088 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FlgP11088 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FlgP11088 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FlgP11088 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FlgP11088 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FlgP11088 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FlgP11088 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FlgP11088 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FlgP11088 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FlgP11088 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FlgP11088 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FlgP11088 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FlgP11088 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FlgP11088 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FlgP11088 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FlgP11088 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FlgP11088 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FlgP11088 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FlgP11088 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FlgP11088 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FlgP11088 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FlgP11088 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FlgP11088 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FlgP11088 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FlgP11088 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FlgP11088 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FlgP11088 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FlgP11088 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FlgP11088 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FlgP11088 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FlgP11088 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FlgP11088 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FlgP11088 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FlgP11088 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FlgP11088 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FlgP11088 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FlgP11088 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FlgP11088 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FlgP11088 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FlgP11088 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FlgP11088 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FlgP11088 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FlgP11088 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FlgP11088 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FlgP11088 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FlgP11088 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FlgP11088 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FlgP11088 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FlgP11088 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FlgP11088 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FlgP11088 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FlgP11088 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FlgP11088 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FlgP11088 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FlgP11088 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FlgP11088 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FlgP11088 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FlgP11088 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FlgP11088 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FlgP11088 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FlgP11088 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FlgP11088 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FlgP11088 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FlgP11088 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FlgP11088 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FlgP11088 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FlgP11088 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FlgP11088 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FlgP11088 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FlgP11088 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms