Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd4P10628 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms