Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms