Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UbbP0CG49 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms