Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Surf1P09925 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Surf1P09925 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Surf1P09925 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf1P09925 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Surf1P09925 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf1P09925 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Surf1P09925 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Surf1P09925 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Surf1P09925 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Surf1P09925 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Surf1P09925 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Surf1P09925 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms