Protein–RNA interactions for Protein: P09581

Csf1r, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1rP09581 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf1rP09581 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Csf1rP09581 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csf1rP09581 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Csf1rP09581 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Csf1rP09581 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csf1rP09581 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csf1rP09581 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Csf1rP09581 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Csf1rP09581 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csf1rP09581 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csf1rP09581 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csf1rP09581 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csf1rP09581 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csf1rP09581 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csf1rP09581 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csf1rP09581 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Csf1rP09581 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csf1rP09581 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Csf1rP09581 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csf1rP09581 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csf1rP09581 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Csf1rP09581 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Csf1rP09581 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csf1rP09581 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Csf1rP09581 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csf1rP09581 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Csf1rP09581 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csf1rP09581 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Csf1rP09581 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csf1rP09581 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Csf1rP09581 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csf1rP09581 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Csf1rP09581 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csf1rP09581 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csf1rP09581 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csf1rP09581 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csf1rP09581 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csf1rP09581 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csf1rP09581 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Csf1rP09581 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csf1rP09581 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csf1rP09581 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csf1rP09581 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csf1rP09581 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csf1rP09581 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csf1rP09581 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Csf1rP09581 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Csf1rP09581 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Csf1rP09581 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csf1rP09581 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Csf1rP09581 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csf1rP09581 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms