Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a2P08122 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms