Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Egr1P08046 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Egr1P08046 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Egr1P08046 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Egr1P08046 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Egr1P08046 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Egr1P08046 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Egr1P08046 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Egr1P08046 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Egr1P08046 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Egr1P08046 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Egr1P08046 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms