Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TtrP07309 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtrP07309 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtrP07309 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtrP07309 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtrP07309 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtrP07309 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtrP07309 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtrP07309 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtrP07309 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtrP07309 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtrP07309 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtrP07309 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TtrP07309 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtrP07309 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TtrP07309 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtrP07309 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtrP07309 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TtrP07309 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TtrP07309 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TtrP07309 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TtrP07309 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TtrP07309 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TtrP07309 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
TtrP07309 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TtrP07309 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TtrP07309 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TtrP07309 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtrP07309 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtrP07309 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtrP07309 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtrP07309 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtrP07309 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtrP07309 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtrP07309 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtrP07309 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtrP07309 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtrP07309 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtrP07309 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtrP07309 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtrP07309 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtrP07309 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms