Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprcP06800 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprcP06800 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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PtprcP06800 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprcP06800 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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PtprcP06800 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprcP06800 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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PtprcP06800 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms