Protein–RNA interactions for Protein: P05524

Fgf3, Fibroblast growth factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf3P05524 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fgf3P05524 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgf3P05524 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms