Protein–RNA interactions for Protein: P01821

Ig heavy chain V region MC101, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01821 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01821 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01821 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01821 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01821 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01821 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01821 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01821 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01821 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01821 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01821 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01821 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01821 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01821 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01821 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01821 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01821 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01821 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01821 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01821 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01821 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01821 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01821 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01821 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01821 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01821 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01821 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01821 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01821 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01821 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01821 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01821 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01821 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01821 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01821 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01821 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01821 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01821 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01821 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01821 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01821 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01821 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01821 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01821 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01821 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01821 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01821 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01821 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01821 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01821 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01821 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01821 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01821 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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