Protein–RNA interactions for Protein: P01804

Ig heavy chain V-III region HPC76 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01804 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01804 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01804 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01804 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01804 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01804 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01804 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01804 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01804 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01804 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01804 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01804 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01804 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01804 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01804 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01804 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01804 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01804 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01804 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01804 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01804 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01804 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01804 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01804 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01804 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01804 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01804 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01804 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01804 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01804 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01804 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01804 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01804 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01804 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01804 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01804 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01804 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01804 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01804 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01804 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01804 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01804 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01804 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01804 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01804 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01804 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01804 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01804 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01804 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01804 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01804 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01804 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01804 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01804 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01804 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01804 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01804 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01804 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01804 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01804 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01804 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01804 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01804 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01804 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01804 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01804 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01804 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01804 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01804 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01804 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01804 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01804 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01804 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01804 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01804 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01804 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01804 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01804 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01804 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01804 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01804 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms