Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01655 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01655 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01655 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01655 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01655 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01655 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01655 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01655 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01655 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01655 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01655 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01655 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01655 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01655 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01655 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01655 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01655 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01655 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01655 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01655 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01655 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01655 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01655 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01655 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01655 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01655 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01655 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01655 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01655 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01655 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01655 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01655 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01655 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01655 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01655 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01655 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01655 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01655 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01655 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01655 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01655 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01655 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms