Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01638 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01638 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01638 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01638 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01638 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01638 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01638 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01638 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01638 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01638 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01638 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
P01638 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01638 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01638 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01638 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01638 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01638 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01638 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01638 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01638 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01638 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01638 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01638 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01638 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01638 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01638 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01638 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01638 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01638 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01638 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01638 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01638 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01638 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01638 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01638 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01638 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01638 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01638 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01638 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01638 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01638 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01638 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01638 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01638 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01638 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01638 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01638 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms