Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C4bP01029 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4bP01029 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4bP01029 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4bP01029 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4bP01029 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4bP01029 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4bP01029 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4bP01029 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4bP01029 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C4bP01029 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4bP01029 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4bP01029 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4bP01029 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4bP01029 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4bP01029 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4bP01029 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4bP01029 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C4bP01029 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4bP01029 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4bP01029 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4bP01029 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4bP01029 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4bP01029 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4bP01029 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C4bP01029 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4bP01029 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4bP01029 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4bP01029 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4bP01029 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4bP01029 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4bP01029 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4bP01029 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4bP01029 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4bP01029 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4bP01029 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4bP01029 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4bP01029 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4bP01029 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4bP01029 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4bP01029 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4bP01029 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4bP01029 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4bP01029 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4bP01029 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4bP01029 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4bP01029 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4bP01029 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4bP01029 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4bP01029 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4bP01029 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4bP01029 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4bP01029 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4bP01029 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C4bP01029 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C4bP01029 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C4bP01029 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C4bP01029 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4bP01029 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4bP01029 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4bP01029 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C4bP01029 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4bP01029 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C4bP01029 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C4bP01029 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C4bP01029 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4bP01029 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4bP01029 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4bP01029 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4bP01029 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4bP01029 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4bP01029 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4bP01029 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4bP01029 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4bP01029 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4bP01029 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C4bP01029 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4bP01029 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4bP01029 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4bP01029 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4bP01029 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4bP01029 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4bP01029 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C4bP01029 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C4bP01029 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C4bP01029 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
C4bP01029 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C4bP01029 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4bP01029 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4bP01029 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4bP01029 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4bP01029 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4bP01029 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4bP01029 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4bP01029 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4bP01029 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4bP01029 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4bP01029 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4bP01029 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4bP01029 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms