Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp8O89110 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp8O89110 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp8O89110 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp8O89110 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp8O89110 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms