Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ccl20O89093 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ccl20O89093 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ccl20O89093 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ccl20O89093 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ccl20O89093 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ccl20O89093 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ccl20O89093 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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