Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcn2O88968 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcn2O88968 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms