Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd7O88665 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd7O88665 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd7O88665 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd7O88665 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd7O88665 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd7O88665 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd7O88665 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms