Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.1 ms