Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CntfrO88507 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntfrO88507 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntfrO88507 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
CntfrO88507 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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