Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Col5a1O88207 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col5a1O88207 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col5a1O88207 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Col5a1O88207 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col5a1O88207 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col5a1O88207 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col5a1O88207 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col5a1O88207 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Col5a1O88207 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col5a1O88207 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col5a1O88207 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col5a1O88207 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col5a1O88207 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col5a1O88207 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col5a1O88207 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col5a1O88207 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col5a1O88207 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a1O88207 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms