Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm6aO70546 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm6aO70546 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms