Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SfnO70456 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SfnO70456 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SfnO70456 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SfnO70456 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SfnO70456 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SfnO70456 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SfnO70456 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SfnO70456 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SfnO70456 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SfnO70456 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SfnO70456 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SfnO70456 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SfnO70456 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SfnO70456 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SfnO70456 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SfnO70456 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SfnO70456 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SfnO70456 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SfnO70456 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SfnO70456 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SfnO70456 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SfnO70456 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SfnO70456 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SfnO70456 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SfnO70456 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SfnO70456 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SfnO70456 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SfnO70456 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SfnO70456 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SfnO70456 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SfnO70456 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SfnO70456 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SfnO70456 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SfnO70456 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SfnO70456 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SfnO70456 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SfnO70456 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SfnO70456 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SfnO70456 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SfnO70456 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SfnO70456 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SfnO70456 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SfnO70456 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SfnO70456 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SfnO70456 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SfnO70456 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SfnO70456 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SfnO70456 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SfnO70456 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SfnO70456 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SfnO70456 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SfnO70456 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SfnO70456 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SfnO70456 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SfnO70456 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SfnO70456 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SfnO70456 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SfnO70456 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SfnO70456 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SfnO70456 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SfnO70456 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SfnO70456 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SfnO70456 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SfnO70456 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SfnO70456 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SfnO70456 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SfnO70456 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SfnO70456 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SfnO70456 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SfnO70456 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SfnO70456 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SfnO70456 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SfnO70456 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SfnO70456 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SfnO70456 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SfnO70456 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms