Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CtssO70370 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtssO70370 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtssO70370 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtssO70370 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtssO70370 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CtssO70370 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtssO70370 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CtssO70370 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtssO70370 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtssO70370 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtssO70370 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtssO70370 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtssO70370 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtssO70370 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtssO70370 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtssO70370 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtssO70370 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtssO70370 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtssO70370 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtssO70370 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtssO70370 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtssO70370 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtssO70370 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtssO70370 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtssO70370 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CtssO70370 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtssO70370 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtssO70370 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CtssO70370 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtssO70370 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtssO70370 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtssO70370 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtssO70370 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtssO70370 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtssO70370 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtssO70370 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtssO70370 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtssO70370 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtssO70370 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtssO70370 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtssO70370 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtssO70370 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtssO70370 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtssO70370 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtssO70370 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtssO70370 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtssO70370 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtssO70370 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtssO70370 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtssO70370 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtssO70370 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CtssO70370 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtssO70370 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtssO70370 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtssO70370 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtssO70370 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtssO70370 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtssO70370 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtssO70370 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtssO70370 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtssO70370 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtssO70370 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtssO70370 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtssO70370 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtssO70370 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CtssO70370 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtssO70370 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtssO70370 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtssO70370 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtssO70370 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtssO70370 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtssO70370 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtssO70370 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtssO70370 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtssO70370 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtssO70370 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtssO70370 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtssO70370 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtssO70370 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtssO70370 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtssO70370 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtssO70370 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtssO70370 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtssO70370 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtssO70370 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtssO70370 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtssO70370 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtssO70370 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtssO70370 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CtssO70370 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtssO70370 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtssO70370 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtssO70370 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtssO70370 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtssO70370 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtssO70370 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtssO70370 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtssO70370 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtssO70370 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms