Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgceO70258 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SgceO70258 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgceO70258 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SgceO70258 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgceO70258 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgceO70258 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SgceO70258 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgceO70258 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgceO70258 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgceO70258 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgceO70258 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgceO70258 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgceO70258 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgceO70258 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SgceO70258 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgceO70258 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgceO70258 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgceO70258 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgceO70258 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgceO70258 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgceO70258 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgceO70258 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgceO70258 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgceO70258 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgceO70258 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SgceO70258 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgceO70258 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgceO70258 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgceO70258 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgceO70258 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgceO70258 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgceO70258 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgceO70258 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgceO70258 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgceO70258 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgceO70258 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgceO70258 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SgceO70258 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgceO70258 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgceO70258 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgceO70258 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgceO70258 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SgceO70258 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SgceO70258 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SgceO70258 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgceO70258 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgceO70258 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgceO70258 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgceO70258 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgceO70258 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgceO70258 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgceO70258 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgceO70258 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgceO70258 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgceO70258 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgceO70258 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgceO70258 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgceO70258 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgceO70258 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SgceO70258 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgceO70258 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgceO70258 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SgceO70258 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgceO70258 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgceO70258 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgceO70258 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgceO70258 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SgceO70258 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgceO70258 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgceO70258 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgceO70258 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgceO70258 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgceO70258 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgceO70258 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgceO70258 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgceO70258 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgceO70258 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgceO70258 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgceO70258 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgceO70258 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgceO70258 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgceO70258 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgceO70258 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgceO70258 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgceO70258 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgceO70258 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgceO70258 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgceO70258 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgceO70258 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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