Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna4O70174 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms