Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChadO55226 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChadO55226 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChadO55226 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChadO55226 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChadO55226 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChadO55226 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChadO55226 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChadO55226 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChadO55226 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ChadO55226 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChadO55226 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChadO55226 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChadO55226 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChadO55226 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChadO55226 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChadO55226 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChadO55226 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChadO55226 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChadO55226 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChadO55226 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChadO55226 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChadO55226 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChadO55226 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChadO55226 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChadO55226 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ChadO55226 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChadO55226 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChadO55226 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChadO55226 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChadO55226 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ChadO55226 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ChadO55226 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChadO55226 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChadO55226 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChadO55226 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChadO55226 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChadO55226 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChadO55226 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChadO55226 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChadO55226 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChadO55226 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChadO55226 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChadO55226 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChadO55226 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ChadO55226 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChadO55226 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChadO55226 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChadO55226 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ChadO55226 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChadO55226 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChadO55226 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChadO55226 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChadO55226 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChadO55226 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChadO55226 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChadO55226 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChadO55226 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChadO55226 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChadO55226 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChadO55226 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChadO55226 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChadO55226 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChadO55226 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChadO55226 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChadO55226 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChadO55226 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChadO55226 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChadO55226 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChadO55226 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChadO55226 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChadO55226 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChadO55226 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChadO55226 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChadO55226 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChadO55226 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChadO55226 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ChadO55226 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChadO55226 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChadO55226 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChadO55226 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChadO55226 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChadO55226 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ChadO55226 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ChadO55226 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms