Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cbx4O55187 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms