Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sap18O55128 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sap18O55128 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sap18O55128 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sap18O55128 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sap18O55128 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sap18O55128 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sap18O55128 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms