Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr1O55100 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms