Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LatO54957 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LatO54957 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LatO54957 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LatO54957 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LatO54957 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LatO54957 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LatO54957 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LatO54957 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LatO54957 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LatO54957 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LatO54957 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LatO54957 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LatO54957 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LatO54957 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LatO54957 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LatO54957 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LatO54957 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LatO54957 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LatO54957 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LatO54957 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LatO54957 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LatO54957 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LatO54957 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LatO54957 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LatO54957 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LatO54957 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LatO54957 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LatO54957 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LatO54957 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LatO54957 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LatO54957 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LatO54957 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LatO54957 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LatO54957 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LatO54957 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LatO54957 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LatO54957 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LatO54957 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LatO54957 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LatO54957 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LatO54957 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LatO54957 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LatO54957 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LatO54957 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LatO54957 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LatO54957 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LatO54957 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LatO54957 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LatO54957 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LatO54957 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LatO54957 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LatO54957 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LatO54957 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LatO54957 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LatO54957 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LatO54957 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LatO54957 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LatO54957 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LatO54957 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LatO54957 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LatO54957 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LatO54957 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LatO54957 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LatO54957 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LatO54957 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LatO54957 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LatO54957 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LatO54957 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LatO54957 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LatO54957 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LatO54957 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LatO54957 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LatO54957 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LatO54957 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LatO54957 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LatO54957 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LatO54957 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms