Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarce1O54941 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarce1O54941 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarce1O54941 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarce1O54941 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarce1O54941 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarce1O54941 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarce1O54941 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarce1O54941 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarce1O54941 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarce1O54941 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarce1O54941 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarce1O54941 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smarce1O54941 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarce1O54941 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarce1O54941 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarce1O54941 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarce1O54941 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarce1O54941 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarce1O54941 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarce1O54941 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smarce1O54941 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarce1O54941 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarce1O54941 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smarce1O54941 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarce1O54941 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarce1O54941 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smarce1O54941 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarce1O54941 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarce1O54941 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smarce1O54941 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarce1O54941 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Smarce1O54941 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarce1O54941 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarce1O54941 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smarce1O54941 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarce1O54941 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smarce1O54941 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarce1O54941 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Smarce1O54941 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarce1O54941 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarce1O54941 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Smarce1O54941 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Smarce1O54941 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Smarce1O54941 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarce1O54941 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarce1O54941 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarce1O54941 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarce1O54941 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarce1O54941 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarce1O54941 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarce1O54941 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Smarce1O54941 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarce1O54941 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smarce1O54941 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarce1O54941 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Smarce1O54941 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarce1O54941 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarce1O54941 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.27■■□□□ 1
Smarce1O54941 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarce1O54941 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarce1O54941 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarce1O54941 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarce1O54941 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smarce1O54941 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarce1O54941 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarce1O54941 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarce1O54941 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarce1O54941 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms