Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Csnk2a2O54833 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms