Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FxnO35943 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FxnO35943 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FxnO35943 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FxnO35943 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FxnO35943 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FxnO35943 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FxnO35943 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FxnO35943 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FxnO35943 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FxnO35943 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FxnO35943 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FxnO35943 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FxnO35943 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FxnO35943 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FxnO35943 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FxnO35943 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FxnO35943 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FxnO35943 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FxnO35943 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FxnO35943 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FxnO35943 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FxnO35943 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FxnO35943 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FxnO35943 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FxnO35943 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FxnO35943 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FxnO35943 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FxnO35943 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FxnO35943 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FxnO35943 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FxnO35943 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FxnO35943 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms