Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek2O35942 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek2O35942 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek2O35942 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nek2O35942 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nek2O35942 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek2O35942 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek2O35942 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek2O35942 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek2O35942 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek2O35942 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek2O35942 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek2O35942 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek2O35942 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek2O35942 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms