Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gp1baO35930 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms