Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Sp100O35892 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Sp100O35892 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sp100O35892 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Sp100O35892 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Sp100O35892 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Sp100O35892 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Sp100O35892 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Sp100O35892 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Sp100O35892 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Sp100O35892 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Sp100O35892 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Sp100O35892 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Sp100O35892 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sp100O35892 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sp100O35892 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sp100O35892 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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