Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf18O35714 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Tnfrsf18O35714 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfrsf18O35714 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms