Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfibp2O35711 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppfibp2O35711 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms