Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc27a2O35488 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc27a2O35488 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc27a2O35488 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc27a2O35488 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc27a2O35488 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc27a2O35488 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc27a2O35488 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc27a2O35488 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc27a2O35488 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc27a2O35488 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc27a2O35488 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc27a2O35488 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc27a2O35488 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc27a2O35488 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc27a2O35488 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc27a2O35488 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc27a2O35488 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc27a2O35488 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc27a2O35488 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc27a2O35488 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc27a2O35488 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc27a2O35488 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms