Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ppef2O35385 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms