Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Abcc1O35379 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abcc1O35379 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Abcc1O35379 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Abcc1O35379 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abcc1O35379 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abcc1O35379 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Abcc1O35379 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Abcc1O35379 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abcc1O35379 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Abcc1O35379 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abcc1O35379 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Abcc1O35379 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abcc1O35379 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abcc1O35379 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abcc1O35379 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abcc1O35379 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Abcc1O35379 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Abcc1O35379 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Abcc1O35379 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abcc1O35379 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abcc1O35379 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abcc1O35379 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abcc1O35379 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abcc1O35379 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abcc1O35379 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abcc1O35379 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Abcc1O35379 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abcc1O35379 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Abcc1O35379 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abcc1O35379 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abcc1O35379 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Abcc1O35379 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Abcc1O35379 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abcc1O35379 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Abcc1O35379 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Abcc1O35379 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Abcc1O35379 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abcc1O35379 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Abcc1O35379 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abcc1O35379 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abcc1O35379 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Abcc1O35379 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Abcc1O35379 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abcc1O35379 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abcc1O35379 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Abcc1O35379 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abcc1O35379 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Abcc1O35379 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Abcc1O35379 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Abcc1O35379 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Abcc1O35379 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Abcc1O35379 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Abcc1O35379 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Abcc1O35379 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Abcc1O35379 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Abcc1O35379 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Abcc1O35379 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Abcc1O35379 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Abcc1O35379 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Abcc1O35379 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Abcc1O35379 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms