Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc18a3O35304 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc18a3O35304 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc18a3O35304 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc18a3O35304 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc18a3O35304 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc18a3O35304 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc18a3O35304 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc18a3O35304 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Slc18a3O35304 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Slc18a3O35304 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Slc18a3O35304 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Slc18a3O35304 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Slc18a3O35304 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Slc18a3O35304 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Slc18a3O35304 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Slc18a3O35304 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Slc18a3O35304 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Slc18a3O35304 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc18a3O35304 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Slc18a3O35304 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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