Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pkd2O35245 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkd2O35245 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkd2O35245 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms