Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe40O35185 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms