Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Degs1O09005 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Degs1O09005 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Degs1O09005 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Degs1O09005 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Degs1O09005 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Degs1O09005 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Degs1O09005 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Degs1O09005 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Degs1O09005 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Degs1O09005 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Degs1O09005 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Degs1O09005 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Degs1O09005 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Degs1O09005 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Degs1O09005 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Degs1O09005 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Degs1O09005 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms