Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dctn1O08788 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms