Protein–RNA interactions for Protein: O08738

Casp6, Caspase-6, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp6O08738 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp6O08738 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp6O08738 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp6O08738 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp6O08738 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp6O08738 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp6O08738 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp6O08738 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp6O08738 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp6O08738 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp6O08738 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp6O08738 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp6O08738 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp6O08738 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms